优点：①疗程相对地固定，而核苷类药物的疗程则相对不固定；②干扰素治疗HBeAg阳性乙肝时，其血清学转换率较高（由HBeAg转换为抗-HBe），一旦取得疗效，就比较持久，有人认为干扰素有“后续作用”，停药后仍有“转阴”效果；③病毒耐药变异少，复发率低，而核苷类药物在停药后多有复发。
缺点：①对HBV DNA的抑制没有核苷类药物强和快；②需要注射给药，不方便，而核苷类药物为口服，每天1片，非常方便；③用药后的不良反应明显，如发烧、头痛、身痛、关节痛等（类似感冒症状），有骨髓抑制现象（白细胞、血小板减少等），还可发生精神异常如抑郁、焦虑、妄想等，也有人发生脱发;④另外一个重要缺点是适应症没有核苷类药物宽广，肝功能失代偿者（肝硬化、重型肝炎时）不能应用，乙肝合并妊娠也不能用干扰素。
由于它的缺点较多，美国人很少应用，但欧洲人却喜欢应用，我国目前的情况是核苷类药物应用多于干扰素。但自长效干扰素（聚乙二醇干扰素）上市后，因为每周注射1次，较前大为简便，其疗效又相当好，使注射干扰素者有所增加，只是其价格昂贵，大多数人不能承受。
应用干扰素的禁忌
绝对禁忌症（即绝对不能使用）：①妊娠。②病人有精神病史，如严重抑郁症。③未能控制的癫痫病人。④病人原有毒瘾没能戒断或酗酒没有戒掉，也不能用干扰素。⑤未能控制的自身免疫性疾病，自身免疫性肝炎、皮肌炎等。⑥失代偿肝硬化（肝硬化出现明显黄疸、腹水、脑病等情况）不能用。⑦有症状的心脏病。⑧治疗前病人的中性粒细胞＜1.0×109/L。⑨治疗前病人的血小板＜50×109/L。
相对禁忌症（必须在医生指导下权衡利弊才能应用）：①甲状腺疾病。②视网膜病。③银屑病（牛皮癣）。④既往曾有抑郁症史。⑤未能控制的糖尿病。⑥未能控制的高血压。7.血清总胆红素＞51微摩尔/升。
由此可见，应用干扰素一定要由专科医生决定，不可自己购买随意应用。即使医生让用，还要在应用中严格监测不良反应。
（辽宁主任医师 王振坤）
干扰素治乙肝 疗程有多长
根据我国《慢性乙型肝炎防治指南》规定，HBeAg阳性慢性乙肝，给予普通干扰素治疗时，每次皮下或肌肉注射500万单位（可根据病人的耐受情况调整每次用量），每周3次或隔日1次（不需每天1次），一般疗程为6个月，如果有效，也可延长疗程至1年或更长。如应用6个月无效，则需改换其它药物。应用聚乙二醇干扰素（长效干扰素）时，每周1次皮下注射，疗程为1年。HBeAg阴性慢性乙肝，疗程要长于HBeAg阳性乙肝，普通干扰素500万单位每周3次或隔日1次皮下或肌肉注射，疗程至少1年。如应用聚乙二醇干扰素，每周1次皮下注射，疗程也是至少1年。
亚洲太平洋地区肝病学会在2008年3月公布了《慢性乙肝管理指南》，关于干扰素疗程的规定与我国的指南大同小异，对于HBeAg阳性慢性乙肝应用普通干扰素的推荐疗程为4~6个月，聚乙二醇干扰素推荐疗程至少6个月；HBeAg阴性乙肝应用普通干扰素推荐疗程至少12个月，应用聚乙二醇干扰素也推荐为至少12个月。